2021-07-20 19:28:32 來源:中國青年網(wǎng)
脫氧核糖核酸示意圖。 視覺中國供圖
2001年2月12日,由美、英、法、德、日和中國6國的科學(xué)家共同參與的國際人類基因組公布了人類基因組圖譜及初步分析結(jié)果。這個被譽為生命科學(xué)“登月計劃”的研究項目取得重大進展,為人類揭開自身奧秘奠定了堅實的基礎(chǔ)。
今年是“人類基因組計劃”協(xié)作組發(fā)表人類基因組序列草圖20周年,這一被譽為生命科學(xué)領(lǐng)域“阿波羅登月計劃”的國際大科學(xué)計劃,也有中國人的身影:拿下其中不可或缺的“1%”。
盡管只參與了1%的任務(wù),但對中國來說意味著一個重要開端。前不久,在中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所、中國科學(xué)院北京基因組研究所和華大基因聯(lián)合舉辦的紀念國際人類基因組工作草圖繪制和“1%項目”完成座談會上,與會院士專家的一個共同觀點是:不要小看了這1%,正是從這1%起步,使我國成為世界上少數(shù)幾個能獨立完成大型基因組分析的國家,帶動我國基因組學(xué)研究從追趕到并跑,躋身世界前列。
從此,中國基因測序研究走向全球第一梯隊。
“1%項目”
1953年,英國科學(xué)家弗朗西斯·克里克和詹姆斯·沃森發(fā)現(xiàn)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)——由含有四種堿基的脫氧核苷酸連接而成的長鏈。這4個“字母”排列組合構(gòu)成了所有物種基因組的“天書”。
如何破譯這部天書,從而了解生命的奧秘?1977年,英國生物化學(xué)家弗雷德里克·桑格等發(fā)明了末端終止測序法,標(biāo)志著第一代DNA測序技術(shù)的誕生。同年,他們測定了第一個基因組序列,全長5375個堿基的噬菌體X174。自此,人類獲得了窺探生命遺傳密碼的能力。
此后,解碼DNA序列的嘗試就從未停止。
1990年10月,“人類基因組計劃”在美國首先啟動,英、日、法、德相繼參與,組成了國際“人類基因組計劃”協(xié)作組,其核心內(nèi)容是測定人類基因組的全部DNA序列,獲得人類全面認識自我最重要的生物學(xué)信息。
這項被譽為生命科學(xué)領(lǐng)域“登月計劃”的“盛宴”,中國要參與嗎?答案是肯定的。
1994年,中國“人類基因組計劃”在談家楨、吳旻、強伯勤、陳竺,以及沈巖、楊煥明等科學(xué)家的倡導(dǎo)下啟動。
中科院院士、華大基因聯(lián)合創(chuàng)始人楊煥明至今記得,1997年11月,在湖南張家界舉行的中國遺傳學(xué)組青年委員會第一次會議上,包括他在內(nèi)的許多青年科學(xué)家商議要加入國際“人類基因組計劃”,推動中國基因組科學(xué)的發(fā)展。
隨后,在中國科學(xué)院和國家南、北方基因組中心同行的支持下,中國科學(xué)院遺傳所(現(xiàn)遺傳發(fā)育所的部分前身)人類基因組中心在1998年8月成立。按遺傳所原所長陳受宜的話說,該中心將“有志于此的人才匯聚一堂”,解決了當(dāng)時我國大規(guī)?;蚪M研究“人才匱乏”的窘境。
次年7月7日,國際“人類基因組計劃”協(xié)作組公布了中國加入“人類基因組計劃”的申請,并于同年9月1日正式向全世界宣布,這標(biāo)志著我國成為美、英、日、法、德之外,第六個 “人類基因組計劃”的參與國家,也是唯一的發(fā)展中國家。
中科院院士、時任國家人類基因組南方研究中心執(zhí)行主任趙國屏介紹,人類基因組包含近兩萬個編碼蛋白質(zhì)的基因,由約30億個堿基對組成,分布在細胞核的23對染色體之中。中國在“人類基因組計劃”中負責(zé)測定和分析3號染色體短臂上從端粒到標(biāo)記D3S3610間大約30厘摩爾(相當(dāng)于3千萬個核苷酸)的區(qū)域,因此被稱為“1%項目”。
“也許‘1%項目’對整個項目而言有些微不足道,但它的實施給我國基因組學(xué)發(fā)展所帶來的意義卻是重大的。同時,‘1%項目’也對社會公眾進行了一次聲勢浩大的基因及基因組普及教育,為中國生命科學(xué)研究和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展開拓了無限的空間?!壁w國屏說。
“中國印記”
2001年8月26日,中科院遺傳所人類基因組中心和國家南、北方基因組中心共同完成了“包干”區(qū)域任務(wù)——“1%項目”的基因序列圖譜,相比國際同行,提前兩年高質(zhì)量完成任務(wù)。
“加入國際‘人類基因組計劃’,可以使中國平等分享該計劃所建立的所有技術(shù)、資源和數(shù)據(jù),并使我國成為世界上少數(shù)幾個能獨立完成大型基因組分析的國家?!睏顭髡f。
2003年4月25日,距離發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋整整半個世紀后,歷時13年,耗資近30億美元的“人類基因組計劃”宣告完成。
作為人類科學(xué)史上的偉大工程,這一計劃帶來了生命科學(xué)的新時代,在發(fā)展過程中建立起來的基因組學(xué)、生物信息學(xué)技術(shù)對生物相關(guān)學(xué)科和產(chǎn)業(yè)起到了巨大的推動作用,有關(guān)生命科學(xué)的新興技術(shù)和生物產(chǎn)業(yè)如雨后春筍般涌現(xiàn)。
楊煥明告訴記者,中國科學(xué)家“搶”到“人類基因組計劃”1%的份額,讓這個人類科技史的重要里程碑上刻下了“中國”二字。更重要的是,它還帶動了中國基因測序技術(shù)從追趕實現(xiàn)并跑,并在測序儀的研制和量產(chǎn)以及生物信息學(xué)軟件的開發(fā)等方面逐漸走向全球第一梯隊。
在他看來,通過參與這一計劃,中國科學(xué)家得以在短時間內(nèi)學(xué)習(xí)并追趕發(fā)達國家的先進生物技術(shù),先后完成了水稻基因組、小麥A基因組、SARS冠狀病毒的基因組研究,以及對熊貓、家豬、家雞、家蠶等動物基因組的測序工作,使我國的基因組研究得以躋身世界前列。
“高歌猛進”
人類基因組草圖發(fā)布20年來,相關(guān)科學(xué)研究突飛猛進。隨著基因組測序技術(shù)的不斷發(fā)展,成本也出現(xiàn)了“斷崖式”下跌。
“人類基因組計劃”在1985年被提出時,可謂是一次“世紀拍板”:當(dāng)時無人知曉測序究竟要花多少錢,于是按1美元一對堿基做的“拍腦袋”預(yù)算,總預(yù)算30億美元。計劃周期為15年,即于2005年完成。
楊煥明說,當(dāng)?shù)谝粋€人類基因組被完全解讀后,科學(xué)界的普遍共識則是迫切需要新的技術(shù)革命。以更低的成本、用更短的時間和更高的效率來準確地測定每個人的基因組。如此,基因組學(xué)才有未來。
如今,自“人類基因組計劃”以來,DNA測序技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)歷4次歷史性飛躍。
2007年5月,“人類基因組計劃”完成4年后,“DNA之父”詹姆斯·沃森拿到了世界上首份個人基因組圖譜。繪制沃森基因組圖譜的“吉姆工程”前后只用了不到兩年時間,花費僅200萬美元。
2008年,全基因組測序的成本降至20萬美元。到2010年,該費用已經(jīng)可以控制在1萬美元以內(nèi)。而據(jù)美國國立衛(wèi)生研究院數(shù)據(jù),到2020年,人類全基因組測序的成本已降低到1000美元以下。
嘗到“甜頭”后,科學(xué)家的創(chuàng)新熱情持續(xù)高漲,又發(fā)明了第三代單分子測序技術(shù)、第四代核苷酸測序技術(shù),可進行單條序列長度更長、更準確的測序。
趙國屏說,正是基于四代測序技術(shù)的“接力賽”,人類基因組序列終于“補齊”,有了更完整的版本。而此前發(fā)表的人類全基因組序列都留有不少“缺口”或“空洞”。
前不久,由加州大學(xué)圣克魯斯分校的卡倫·米加和國家人類基因組研究所的亞當(dāng)·菲利皮領(lǐng)導(dǎo)的“端粒到端?!甭?lián)盟繪制的新版本基因組新版本,比2001年的版本增加了近兩億個堿基對以及2226個新基因,使人們獲得了約30.55億對堿基對的完整信息。這一結(jié)果填補了之前剩余的大部分缺口,是自人類參考基因組首次發(fā)布以來進行的最大改進。
2018年9月30日,詹姆斯·沃森等人在《自然》雜志共同撰文指出:“人們常常以為,是先有科學(xué)發(fā)現(xiàn)再有技術(shù)發(fā)明,科學(xué)發(fā)現(xiàn)和技術(shù)發(fā)明存在單向關(guān)系,其實不然?!?/p>
他們認為:很多科學(xué)發(fā)現(xiàn)都是由技術(shù)發(fā)明推動的。比如,由于玻璃磨制技術(shù)的改進,發(fā)明出了望遠鏡,天文學(xué)才得以空前進步;再如,萊特兄弟發(fā)明了飛機,其后才有空氣動力學(xué)。有了DNA測序技術(shù)的進步和工具的發(fā)展,基因組科學(xué)才有如此驚人的突破性發(fā)展。
“曙光初現(xiàn)”
20年來,這一破譯“生命天書”劃時代的成就,給人類對疾病和物種演化的認知帶來了革命性變化?;驕y序技術(shù)不斷進步,測序成本以“超摩爾速度”直線下降,新的基因組藥物不斷問世,科學(xué)家們解密的致病基因越來越多。
人類基因組研究院主任埃里克·格林從第一天起就參與了“人類基因組計劃”,他曾想象有一天基因組學(xué)可能會成為臨床治療的一部分,“但我真的沒想到這會在我有生之年發(fā)生。”
2010年,科學(xué)家懷揣了數(shù)十年的夢想成為現(xiàn)實。
那一年,罹患罕見致命性腸道感染病的6歲美國男孩尼古拉斯·沃爾克,成為世界上第一個被基因測序技術(shù)拯救的兒童?;驕y序發(fā)現(xiàn)他有一個出人意料的基因突變,通過從臍帶血中取出細胞進行骨髓移植,取得了良好療效。
趙國屏說,這一奇跡給了科學(xué)家巨大的信心。近年來,又有多位地中海貧血、白血病患者受益于基因技術(shù)被治愈。這些成果向人們展示了基因科技造福人類的前景。
自2001年開始,每年關(guān)于蛋白編碼基因的學(xué)術(shù)論文數(shù)量在1萬篇到兩萬篇,很多研究集中在一些“超級明星基因”上,這對深入認識重要的基因十分關(guān)鍵。
2001年之前,明確某種藥物全部蛋白靶點的概率不到50%。“人類基因組計劃”完成后,美國每年通過的藥物幾乎都有清楚的作用靶點說明。
“人類基因組序列就像化學(xué)元素周期表對化學(xué)一樣重要,可以知道世界是由多少種元素組成。而基因組提供了遺傳信息,人的生、老、病、死都與基因組圖譜密切相關(guān),其重要性不言而喻。”楊煥明說。
他同時表示,相比未來,生命科學(xué)的組學(xué)時代才曙光初現(xiàn)。新冠肺炎疫情來襲也再次提醒人類:我們對生命的認識還遠遠不夠。要真正破譯生命這本天書,科學(xué)家還需要攜手構(gòu)建生命科學(xué)的“大數(shù)據(jù)”時代。
中青報·中青網(wǎng)記者 邱晨輝 來源:中國青年報
編輯:海洋